广东医科大学体育教学部的历史可追溯至1958年建校之初，其前身为湛江医学院“体育教研组”。1992年，该教研组更名为“体育教研室”，隶属于基础部（现为基础医学院）。2007年，体育教研室脱离基础部，独立设置为“体育部”。2014年，“体育部”正式更名为“体育教学部”至今。

体育教学部下设综合办公室、公共体育教研室、体质测试中心、运动竞赛中心及体育场馆中心。现有教职员工44人，其中专任教师37人，具有硕士以上学位29人（含博士1人），占教师总数的78.4%；拥有高级职称教师17人（教授1人，副教授16人），占比为45.9%。管理体育场馆总面积达59620.14平方米（室内4420.61平方米，室外55199.53平方米），全面负责两校区的公共体育教学、运动训练与竞赛、群众体育活动及学校各项体育工作。

体育教学部坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入学习贯彻习近平总书记关于教育和体育的重要论述，深化“党建+”模式，推动党建与教学、科研、竞赛、育人深度融合，全面落实立德树人根本任务。秉持“健康第一”的教育理念，依托学校医学专业优势，积极推动“体教医融合”发展。探索将学生体质监测、医学通识教育与民族传统体育文化相融合的有效路径，优化课程设置，推广中华传统体育项目，全面提升学生体质健康水平，曾荣获广东省首届大学生体质健康测试大赛团体一等奖，育人成效广受主流媒体关注，相关育人成果多次被《中国教育报》、学习强国等平台刊发报道；“体育融合育英才”典型案例入选国家体育总局编纂的《中国体育年鉴》，育人特色鲜明、示范效应突出。1人获评2021年度“南粤优秀教师”；1人获批2024年度国家社科基金一般项目，同时入选省级课程思政示范项目；1人荣获2026年广东省教育评价改革主题征文普通高校本科组一等奖；教学团队荣获2025年广东省教育教学成果奖二等奖。排舞队荣膺国赛六连冠、省赛六连冠，健身气功队获国赛一等奖，田径队获国赛3项第一名、女子团体第二、男女团体第三，空手道队实现省赛三连冠，游泳队出征省赛全胜夺冠、多次打破赛会纪录，男子足球队获省赛甲组第一名，女子排球队获省赛甲 B 组冠军、国赛女子气排球组季军、省赛女子气排球组冠军；骆熙彤入选第十五届全运会广东省代表队，建校以来首位全运会学生运动员。累计获国家级、省级奖项560余项。

体育教学部秉持“为党育人、为国育才”的初心使命，承担学校本科一、二年级学生的体育课程教学任务，不断深化教育教学改革，拓展体育选修课程，增设中华传统体育项目，完善“学、练、赛”一体化培养机制，致力于转变学生学习态度，推动从“要我学”向“我要学”的积极转化。帮助学生掌握体育基本知识、技能与方法，培养经常锻炼的习惯与终身体育意识，塑造顽强拼搏、创新进取的品格与生活态度，引导学生在体育锻炼中享受乐趣、增强体质、健全人格、锤炼意志，努力培养德智体美劳全面发展的社会主义建设者和接班人。